一、CRISPR文库筛选体内(in vivo)应用
1.癌症研究:这是体内CRISPR筛选最广泛的应用方向,旨在揭示肿瘤发生、进展和治疗响应机制。重点包括鉴定肿瘤依赖基因、转移驱动因子、药物抵抗机制以及免疫逃逸途径。通过移植模型或直接体内编辑(如AAV病毒递送),筛选可模拟肿瘤微环境。
2.感染性疾病:用于发现宿主-病原体相互作用的关键基因,特别是病毒感染的宿主因子。筛选帮助识别病毒复制必需的细胞途径,支持抗病毒药物开发。
3.免疫学与免疫治疗:探索免疫细胞(如T细胞)中的基因调控网络,鉴定增强癌症免疫治疗的靶点。体内筛选考虑免疫系统完整性,揭示肿瘤与免疫细胞的交互。
4.心血管疾病:探究胆固醇代谢、炎症和心脏发育相关基因,支持动脉粥样硬化等疾病的机制研究和靶点发现。
5.神经科学与发育生物学:分析神经元功能、发育过程和相关疾病(如自闭症)基因,结合单细胞读出技术揭示复杂表型。
6.代谢与内分泌疾病:如糖尿病研究,鉴定调控胰岛素分泌或代谢通路的基因。
7.其他细胞过程:包括自噬、信号通路和药物毒性研究,扩展到多基因交互和合成致死分析。
这些方向的优势在于生理相关性高,能捕捉体外难以模拟的交互(如细胞-细胞接触、免疫响应)。挑战包括递送效率低、离靶效应干扰结果准确性和库覆盖率不足易遗漏关键基因。未来前景明确,随着单细胞测序和改进递送(如纳米载体)的整合,将加速精准医学应用。
二、CRISPR文库体内(in vivo)筛选服务
标准化流程,确保文库多样性>95%和均匀覆盖。步骤如下:
1. 文库设计:根据您的靶基因列表(单基因或全基因组),使用算法优化sgRNA序列(每基因4-10个sgRNA)。
2. 寡核苷酸合成:合成高纯度寡核苷酸池,包含U6启动子驱动的sgRNA。
3. 载体克隆:将寡核苷酸池克隆入慢病毒载体(如lentiCRISPR v2),转化E. coli产生质粒库。
4. 细胞转导:使用慢病毒转导目标细胞系(如HEK293或原代细胞),MOI=0.3控制覆盖率。
5. 验证与扩增:NGS测序验证文库完整性,扩增至10^8-10^9细胞规模。
输出:冻存细胞文库 + 验证报告。
基于您的需要的小鼠模型,构建可靠的体内筛选平台,确保移植成功率>90%。步骤如下:
1. 动物准备:选择对应小鼠(如B6、NSG)不同的处理以适应移植。
2. 细胞移植:静脉或皮下注射文库细胞(1-5×10^6细胞/侧),分组设置对照(非靶向sgRNA)。
3. 模型监测:跟踪肿瘤生长曲线或疾病进展,持续2-6周。
4. 组织收获:解剖收集目标组织(如肿瘤),分离富集细胞或者直接裂解。
5. 下游分析:NGS定量sgRNA丰度,鉴定富集/耗竭基因。
输出:筛选数据 + 打分基因列表 + 动物模型报告。

针对体内直接递送研究,海星提供AAV病毒文库定制,支持肝脏、脑或肌肉靶向。步骤如下:
1. 载体设计:整合sgRNA文库至AAV骨架(如AAV2/8血清型),优化ITR和启动子。
2. 病毒包装:瞬时转染HEK293细胞,HEK293T辅助包装产生高滴度病毒(>10^12 vg/mL)。
3. 纯化与滴度:密度梯度超速离心纯化,qPCR测定病毒滴度。
4. 质量控制:空壳率<10%、NGS验证文库完整性,无内毒素污染,符合注射标准。
5. 分装存储:冻干或-80°C保存,提供体积分装。
输出:AAV病毒文库 + 滴度证书 + 序列验证报告。
三、海星生物 CRISPR文库体内筛选服务优势
⚠️ 数据安全:严格保密协议,符合GLP标准。
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