1、推荐的扫描仪
Ÿ RPAS 710-G Microarray Scanner (RayBiotech, Inc)
Ÿ InnoScan 300 Microarray Scanner (Innopsys, Inc)
Ÿ GenePix® 4000A (Molecular Devices Corporation)
Ÿ GenePix® 4000B (Molecular Devices Corporation) Ÿ GenePix® 4100A (Molecular Devices Corporation)
Ÿ GenePix® Professional 4200A (Molecular Devices Corporation)
Ÿ ScanArray® Lite (PerkinElmer, Inc.)
Ÿ ScanArray® Express (PerkinElmer, Inc.)
Ÿ ScanArray® Express HT (PerkinElmer, Inc.)
Ÿ LS Series Laser Scanner (Tecan Group AG)
Ÿ AlphaScan Microarray Scanner (Alpha Innotech)
Ÿ DNA Microarray Scanner (Agilent Technologies*)
Ÿ The DNAscope LM (Biomedical Photometrics Inc.)
Ÿ The DNAscope IV & V (Biomedical Photometrics Inc.)
Ÿ Open Frame DNAscope (Biomedical Photometrics Inc.)
Ÿ Revolution 4200 Microarray Scanner (VIDAR Systems Co)
Ÿ aQuire 110V (Genetix)
Ÿ aQuire 240V (Genetix)
Ÿ VersArray ChipReader 5um System (Bio-Rad)
Ÿ VersArray ChipReader 3um System (Bio-Rad)
2 荧光扫描仪应具备的参数条件
玻片标准大小:25mmx75mm
Ÿ 检测图片输出:16-bit/32-bitTIFF格式图片
一般来说,大多数基因芯片扫描仪都可以使用,只要他们有一个Cy3标记(绿色)通道和≤20μm的像素分辨率,并能够扫描标准大小的玻片即可。 RayBio扫描仪 |
3 多重PMT强度扫描玻片芯片:如果样品中不同细胞因子的信号强度差距很大,例如用同一个PMT强度扫描一张玻片(例如PMT=650Genepix4000B,不同扫描仪强度标准可能不同),如果某个细胞因子例如IL-6在各样品中都已经达到信号强度饱和,可降低PMT强度来扫描,使该因子信号处于直线检测范围内;如果某个细胞因子例如MIG在各样品中信号都很弱(信号值可能小于200或500),可增加PMT强度来扫描,使得信号增强。
4 玻片芯片数据提取注意事项
(1)提取信号数据,圈的直径可设置在110-120μm, 且全部信号都使用相同的直径圈读;
(2)建议选用信号的Median值;
(3)每个信号可扣除周边背景(localbackground)影响;
(4)如果信号点出现“蝌蚪小尾巴”可忽视其影响,在正常信号位点上取值;
(5)芯片上设置2-4个重复点,可去除明显的异常点进行数据分析。
目录合集:
一、什么是蛋白质芯片:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1535&id=1535
二、蛋白质芯片是如何产生的:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1536&id=1536
三、蛋白质芯片有什么优点:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1537&id=1537
四、蛋白质芯片都有哪些分类:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1538&id=1538
五、蛋白质芯片的应用有哪些方面:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1539&id=1539
六:蛋白质芯片的原理是什么:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1540&id=1540
七:蛋白质芯片适合检测什么样品,该如何收集样品:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1541&id=1541
八:膜芯片都有哪些方法对结果进行拍照:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1542&id=1542
九:玻片芯片都要哪些仪器可以扫描结果:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1543&id=1543
十:蛋白质芯片的结果可以保存吗:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1544&id=1544
十一:蛋白质芯片操作复杂吗,有哪些注意事项:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1545&id=1545
十二:蛋白质芯片得到的大量数据该如何处理:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1546&id=1546
十三:Raybio芯片常见疑问:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1547&id=1547
十四:蛋白质芯片的实物图:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1548&id=1548
十五:Raybio芯片新技术介绍:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1549&id=1549
十六:使用Raybio芯片产品中国部分参考文献:http://www.ny-bio.com/cn/nd.jsp?id=1550&id=1550