CRISPR文库筛选服务
服务优势
智能化平台
CRISPRSeek™ 技术实现低背景、高效率敲除,全新人工智能算法让脱靶率下降20% 。
CRISPRSeek™服务类型与应用场景
CRISPR-KO文库
应用:全基因组功能丧失筛选,挖掘与疾病相关基因。利用CRISPR-KO文库筛选可以在成千上万的基因中精准定位关键靶点,为新型靶点发现提供依据。
应用:功能获得型筛选,研究基因过表达对表型的影响。通过CRISPRa文库激活特定基因表达,发现潜在基因激活后能够提升细胞存活率,发现新的潜在基因靶点。
应用:必需基因功能研究,非编码RNA调控机制探索。利用CRISPRi文库筛选癌细胞中必需基因的下游调控因子,揭示全新信号通路,为抑制肿瘤生长提供新策略。
CRISPRSeek™文库筛选服务流程
1. 文库构建:定制gRNA设计、引物合成与载体构建,提供1K-92K宽库容选择。
2. 文库扩增:确保99%覆盖度与均一性低于10。
3. 文库病毒:高滴度制备文库病毒颗粒,提供1-100mL规格。
4. 文库细胞:自动化生产,400+种细胞可选,文库细胞覆盖度超过95%。
5. 功能筛选:提供全面筛选方案顾问,细胞流式分选平台可选。
6. 数据分析:CRISPRSeek™算法平台深度测序与数据解析,输出丰富数据图表。
CRISPRSeek™文库交付内容
服务项目 | 服务详情 | 交付内容 |
sgRNA文库设计定制、扩增、质控 | sgRNA设计、sgRNA-oligo pool合成、文库质粒构建、文库质粒扩增、NGS质控 | 文库质粒:100ug NGS质控报告(覆盖度>99%) |
Cas9稳转细胞株定制 | Cas9慢病毒包装、Cas9稳转株构建、编辑活性检测 | Cas9稳转株(1×106/Vials) |
文库慢病毒包装 | 文库病毒包装与滴度测定(细胞滴定法),确保活病毒滴度>1×108 TU/mL | 1mL:1×108 TU总量; 5mL:5×108 TU总量; 10mL:1×109 TU总量; 病毒滴度检测报告 |
文库细胞构建 | MOI<0.3的转染条件摸索、文库细胞文库构建 | 小规格:1×107细胞总量; 中规格:5×107 细胞总量; 大规格:1×108 细胞总量; |
功能筛选实验 | 个性化的功能筛选服务:药物筛选、病毒感染、细菌感染、流式分选等 | 实验报告 |
NGS分析 | sgRNA测序建库和NGS测序、生信分析 | 实验报告、NGS测序原始数据 |
40多种现货文库质粒—质粒覆盖度>99%,均一性<10
40多种现货文库病毒—活力强、滴度高,即用型
400多种现货文库细胞株—细胞覆盖度>99%,均一性<10
应用案例
· 典型应用
全基因组筛选:利用CRISPR-KO文库对癌细胞进行全基因组筛选,发现与耐药相关的基因。
信号通路研究:基于CRISPRi文库靶向通路基因,揭示基因的功能或者调控作用。
药物靶点挖掘:通过CRISPRa文库筛选,在细胞中上调基因表达,鉴定出增强表型的新基因。
· CRISPRSeek™ 文库筛选技术服务的典型应用场景:
1. CRISPR-KO文库筛选如何在全基因组筛选
案例:新冠病毒宿主因子筛选,研究人员使用CRISPR-KO文库筛选新冠病毒感染的关键宿主基因,发现敲除 ACE2 和 TMPRSS2 显著降低病毒侵染效率。文献:Daniloski, Z., et al. (2021). "Identification of Required Host Factors for SARS-CoV-2 Infection in Human Cells." Cell, 184(1), 92-105.e16.
链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.10.030
2. CRISPRa文库筛选如何做药物靶点挖掘
描述:筛选对细胞存活或疾病进程关键的基因,作为药物靶点。案例:BRAF抑制剂耐药,CRISPRa文库筛选发现激活 EGFR 导致BRAF抑制剂耐药,为联合治疗提供新策略。文献:Konermann, S., et al. (2015). "Genome-scale transcriptional activation by an engineered CRISPR-Cas9 complex." Nature, 517(7536), 583-588.
链接:https://doi.org/10.1038/nature14136
3. CRISPRi文库筛选如何做必需基因研究
描述:通过CRISPRi敲降必需基因,研究其功能。案例:首次使用CRISPRi文库,敲降全基因组(包括必需基因),结合CRISPRa(激活),研究表达调控。
文献:Gilbert et al. (2014) "Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation" Cell. 2014 Oct 23;159(3):647-61.
链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2014.09.029
海星生物的CRISPRSeek™文库筛选服务覆盖从全基因组筛选到特定基因家族、信号通路、药物靶点挖掘、非编码RNA研究、必需基因研究,再到表观遗传调控等多种场景。我们的服务已在癌症研究、神经科学、再生医学及工业生物技术等领域展现出强大潜力。立即联系我们,开启您的精准基因筛选之旅!